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Gnuplot
Introduction
Gnuplot est une puissante interface pour la représentation graphique de données provenant d'un fichier texte. Il peut soit afficher l'image, soit enregistrer une image dans divers formats, y compris LaTeX. Par exemple, dans un processus de calcul numérique, il est souvent intéressant de stocker régulièrement les paramètres principaux du schéma (erreur, résidu, n° de l'itération, différents indices, etc.). Le plus simple étant de générer un fichier texte associé au calcul, dans lequel on range les données par colonne.
Pour lancer Gnuplot, dans un terminal, taper :
gnuplot
Gnuplot se lance alors directement dans la fenêtre active du terminal, et on obtient quelque chose qui ressemble à ça :
alarat@troll:~/High_Order$ gnuplot
G N U P L O T
Version 4.0 patchlevel 0
last modified Thu Apr 15 14:44:22 CEST 2004
System: Linux 2.6.15-27-686
Copyright (C) 1986 - 1993, 1998, 2004
Thomas Williams, Colin Kelley and many others
This is gnuplot version 4.0. Please refer to the documentation
for command syntax changes. The old syntax will be accepted
throughout the 4.0 series, but all save files use the new syntax.
Type `help` to access the on-line reference manual.
The gnuplot FAQ is available from
http://www.gnuplot.info/faq/
Send comments and requests for help to
<gnuplot-info@lists.sourceforge.net>
Send bugs, suggestions and mods to
<gnuplot-bugs@lists.sourceforge.net>
Terminal type set to 'x11'
gnuplot>
Si vous n'obtenez pas ça, c'est que Gnuplot n'est pas (est mal) installé.
Installer Gnuplot
Gnuplot est installé par défaut lors de l'installation d'Ubuntu. Si il n'est pas actuellement installé sur votre machine, vous avez plusieurs méthodes. Pour une utilisation ponctuelle, préférer la première.
Méthode classique
À partir des sources
Indispensable pour pouvoir profiter des options de complétion et d'historique. C'est pour cette raison que cette doc a été écrite. Référez vous à la section Completion Bash et Historique.
Utiliser Gnuplot
Nous rassemblons ici quelques commandes de base pour l'utilisation de ce logiciel. Le site officiel de Gnuplot est inévitable pour un utilisateur plus demandeur.
Directement dans un terminal
Après avoir lancé Gnuplot, on obtient alors la ligne de commande suivante :
gnuplot>
Pour créer un graphe, dans cette ligne taper la commande :
plot 'adresse_du_fichier_a_ploter' using colonne_valeurs_abscisse:colonne_valeurs_ordonnee
L'option 'using' peut être raccourcie en 'u'. Par défaut, Gnuplot représente un nuage de points. Pour obtenir une ligne brisée, il faut ajouter l'option 'with lines', qui dans sa version raccourcie devient 'w l'.
Ainsi, pour afficher la ligne brisée représentant la cinquième colonne en fonction de la première colonne du fichier "Resultats", se trouvant dans le dossier père du dossier dans lequel on a lancé Gnuplot, on doit taper la commande :
plot '../Resultats' u 1:5 w l
Il s'ouvre alors une nouvelle fenêtre pour l'affichage du graphique.
Maintenant, si on veut rajouter le nuage de points représentant la troisième colonne en fonction de la deuxième colonne du fichier "Nouveau_Resultats" du dossier courant, sur cette même représentation graphique, il faut taper la commande :
plot '../Resultats' u 1:5 w l, 'NouveauResultats' u 2:3
Il existe des raccourcis clavier pour activer des options directement sur la fenêtre de représentation graphique. Ainsi, si l'on tape 'l', on obtient une représentation logarithmique en ordonnée, et si l'on tape 'Maj+L', on obtient une représentation logarithmique en la coordonnée la plus proche du curseur de la souris. Pour plus d'info sur les raccourcis :
man gnuplot
Avec un fichier de configuration
En fait Gnuplot est un logiciel extrêmement puissant pour la représentation de données, puisqu'il est conçu pour être lancé à partir de scripts. On peut donc dans un fichier de configuration, rentrer des lignes de commandes Gnuplot qui permettent d'effectuer des actions en cascades sur un même fichier de données.
il est possible de donner un nom aux axes et un titre au graphique en envoyant la commande :
gnuplot load nom_du_fichier_config
Ce fichier pourrait par exemple contenir :
set title ' Flux en fonction du temps: ' set xlabel ' Temps (jj/mm) / (HH/MM)' set ylabel ' Flux ' set xdata time set timefmt "%d%m%H%M" set format x "%d/%m\n%H/%M" plot "flux.flx" using 1:2 with lines
À partir d'un programme en C
Voici un exemple en deux fichiers, l'un pour le code C :
#include <stdio.h> #include <stdlib.h> #define GNUPLOT_PATH "/usr/bin/gnuplot" int main() { FILE *gp; gp = popen(GNUPLOT_PATH, "w"); if(gp == NULL){ fprintf(stderr, "Oops, I can't find %s.", GNUPLOT_PATH); exit(EXIT_FAILURE); } fprintf(gp, "cd '~/Desktop'\n load \"config\"\n"); fflush(gp); /* On oublie pas le buffer. */ getchar(); pclose(gp); exit(EXIT_SUCCESS); }
Dans la 7eme ligne de main, on demande a gnuplot d'exécuter des instructions. D'abord il change de répertoire puis il charge le fichier config.
Vous aurez compris que config est l'autre fichier, il contient des instructions gnuplot. Par exemple :
# fichier modèle d'utilisation de gnuplot # vous pouvez aussi l'utiliser simplement en faisant en ligne de commande : # gnuplot monfichier set terminal X11 set size 0.8,0.8 set nokey set xrange [-0.1:10] #set yrange [0:110] M=3 k=3 plot (1-exp(-k*x)) pause -1 "Faire retour" # permet d'attendre que l'utilisateur ait vu la figure quand on fait une sortie X11
Les lignes commençant par # sont des commentaires. Copiez ce fichier sur votre bureau et appellez le config.
Complétion Bash et historique
Démarche
Ces deux options ne sont pas mises par défaut dans Ubuntu, car Gnuplot est disponible sous une licence spéciale, qui interdit sa distribution après modification. Il serait ainsi illégal de mettre ici un lien vers un package recompilé à partir des sources de Gnuplot. Par contre, ce tuto est tout à fait autorisé, et vous avez le droit de suivre ses instructions pour une utilisation personnelle du logiciel !
Pour activer la complétion et l'historique de Gnuplot en mode terminal, il vous faudra télécharger les sources du logiciel, puis les recompiler avec les options nécessaires, en faisant bien attention aux dépendances requises. Vous obtiendrez alors un nouveau package qu'il vous suffira d'installer sur votre distribution. Enfin, il faudra bloquer la version de votre nouveau Gnuplot, afin que vos gestionnaires de mise-à-jour ne détruisent pas votre travail à chaque upgrade.
Sources
Tout d'abord, si ce n'est pas déjà fait, ajouter le dépôt-source universe dans vos dépôts.
On peut maintenant obtenir les sources du logiciel. Se placer dans /usr/local/src (ceci n'est pas obligatoire) et y télécharger les sources de Gnuplot :
cd /usr/local/src sudo apt-get source gnuplot
Nouveau package Gnuplot
Tout d'abord, installer la bibliothèque readline et les dépendances qui permettront de compiler le package Gnuplot avec les options de complétion et d'historique : installez les paquets libreadline5 libreadline5-dev ibxt-dev libgd2-noxpm-dev debhelper texinfo tetex-bin tetex-extra.
Puis aller dans le répertoire /etc/apt/src/gnuplot-*.*.*/debian/ (les étoiles correspondant à la version) :
cd /usr/local/src/gnuplot-*.*.*/debian/
Éditer le fichier rules.
et remplacer l'option –without-gnu-readline par –with-readline=gnu. Ceci active la complétion. Pour l'historique, ajouter dans la même ligne l'option : –enable-history-file.
On obtient ainsi le paragraphe :
config.status: configure
dh_testdir
# Add here commands to configure the package.
./configure $(confflags) CFLAGS="$(CFLAGS)" \
--prefix=/usr --mandir=\$${prefix}/share/man \
--infodir=\$${prefix}/share/info \
--datadir=\$${prefix}/share/gnuplot \
--libexecdir=\$${prefix}/lib/gnuplot \
--with-readline=gnu --enable-history-file --without-lasergnu \
--with-png --with-gd --without-lisp-files \
--without-linux-vga --with-gihdir=\$${prefix}/share/gnuplot
Remonter dans le dossier père et compiler le paquet :
cd .. sudo dpkg-buildpackage
Il est tout à fait possible qu'il vous manque encore des dépendances. Dans ce cas, le compilateur stoppe au bout de très peu de temps. Il vous suffit alors de lire attentivement les messages d'erreurs pour savoir quelles dépendances vous manquent, les installer, et recompiler. La compilation prend quelques minutes (selon les architectures…). Merci de signaler d'éventuelles difficultés.
Installer le nouveau package
Remonter encore d'un dossier et installer le nouveau paquet :
cd .. sudo dpkg -i gnuplot-*.deb
Les fichiers .deb sont les fichiers du nouveau package Gnuplot. Conservez les précieusement, car Gnuplot rentre désormais en conflit avec vos gestionnaires de mise-à-jour. En effet, ils considèrent que votre nouvelle version de Gnuplot est antérieure à celle disponible sur les dépôts. Il est possible que par une fausse manipulation vous remettiez à jour Gnuplot. Vous perderiez alors la complétion et l'historique. Vous pourrez les remettre en service grâce à :
cd /usr/local/src/ sudo dpkg -i gnuplot-*.deb
Bloquer les mises à jour
Voici une solution possible pour geler le package gnuplot à son état actuel. Il existe certainement d'autres manières, peut-etre plus simples. Merci d'en faire profiter tout le monde.
Jusqu'à hardy, poser un 'hold' sur les paquets Gnuplot dans aptitude ou Synaptic, ne résoud pas le problème : gnuplot-nox apparait systématiquement dans le gestionnaire de mise-à-jour (quel qu'il soit). La solution : dselect.
Il n'y a pour l'instant pas de doc sur dselect sur ce site web, c'est pourquoi la méthode ci-dessous reste encore assez mystérieuse.
Dans un terminal, taper :
sudo dselect
On obtient l'interface suivante :
Debian `dselect' package handling frontend. 0. [A]ccess Choose the access method to use. 1. [U]pdate Update list of available packages, if possible. * 2. [S]elect Request which packages you want on your system. 3. [I]nstall Install and upgrade wanted packages. 4. [C]onfig Configure any packages that are unconfigured. 5. [R]emove Remove unwanted software. 6. [Q]uit Quit dselect. Move around with ^P and ^N, cursor keys, initial letters, or digits; Press <enter> to confirm selection. ^L redraws screen. Version 1.13.11 (i386). Copyright (C) 1994-1996 Ian Jackson. Copyright (C) 2000,2001 Wichert Akkerman. This is free software; see the GNU General Public Licence version 2 or later for copying conditions. There is NO warranty. See dselect --licence for details.
- Se placer sur la ligne 2. (avec les flèches directionnelles ou en tapant sur 'S').
- Taper 'Entrée'.
- Taper sur la barre d'espace pour quitter l'aide.
Vous êtes maintenant dans le gestionnaire de paquet dselect :
- Taper '/' (Maj+'/') pour effectuer une recherche
- Rechercher 'gnuplot'
- La touche 'n' permet de se déplacer d'un package contenant la chaine de caractère 'gnuplot' à un autre. Se déplacer jusqu'à ces trois lignes :
─────── Up-to-date Optional packages in section universe/math ───────
*** Opt universe gnuplot 4.0.0-2.1 4.0.0-2.1 A command-line driven interactive plotting program
*** Opt universe gnuplot-nox 4.0.0-2.1 4.0.0-2.1 A command-line driven interactive plotting program
*** Opt universe gnuplot-x11 4.0.0-2.1 4.0.0-2.1 X11-terminal driver for gnuplot
Les trois étoiles en début de ligne marquent l'état d'installation des packages. Il s'agit maintenant de les bloquer à la mise à jour.
- Se placer sur chacune des lignes et taper « = ». Cette action « hold » les packages à leur version actuelle
- On obtient alors :
─────── Up-to-date Optional packages in section universe/math ───────
*== Opt universe gnuplot 4.0.0-2.1 4.0.0-2.1 A command-line driven interactive plotting program
*== Opt universe gnuplot-nox 4.0.0-2.1 4.0.0-2.1 A command-line driven interactive plotting program
*== Opt universe gnuplot-x11 4.0.0-2.1 4.0.0-2.1 X11-terminal driver for gnuplot
Il faut maintenant quitter dselect :
- Taper « Entrée ».
- Normalement, on arrive dans l'aide qui vous demande de taper sur « space » pour quitter. Taper sur la barre d'espace.
- Taper à nouveau sur « Entrée ».
- On est revenu au menu initial. Descendre à la ligne 6. par les flèches ou en tapant « Q ».
- C'est gagné. Normalement, aucun des gestionnaires de mise à jour n'accepte de mettre Gnuplot à jour.

Contributeur : laden.
