Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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jmol [Le 15/01/2011, 21:55] kamui57 ajout des tags |
jmol [Le 31/08/2022, 23:32] (Version actuelle) moths-art Passage de http à https sur les liens externes (détecté et corrigé via le bot wiki-corrector (https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=2067892) |
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| - | {{tag>Karmic Lucid chimie éducation BROUILLON}} | + | {{tag>Focal Bionic éducation}} |
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| - | + | {{ :education:jmol_logo.png}} | |
| - | ====== JMol ====== | + | ====== Jmol ====== |
| Jmol est un outil de visualisation de molécules gratuit, open source pour les étudiants, les éducateurs et les chercheurs en chimie et en biochimie. Il est multi-plateformes, fonctionnant sous Windows, Mac OS X et les systèmes Linux/Unix. | Jmol est un outil de visualisation de molécules gratuit, open source pour les étudiants, les éducateurs et les chercheurs en chimie et en biochimie. Il est multi-plateformes, fonctionnant sous Windows, Mac OS X et les systèmes Linux/Unix. | ||
| - | * JmolApplet est une applet pour navigateur web qui peut être intégrée dans des pages web. | + | * JmolApplet est une applet pour navigateur web qui peut être intégrée dans des pages web. |
| - | * L'application Jmol est une application Java indépendante qui fonctionne sur le bureau. | + | * L'application Jmol est une application Java indépendante qui fonctionne sur le bureau. |
| - | * JmolViewer est un kit de développement qui peut être intégré dans d'autres applications Java. | + | * JmolViewer est un kit de développement qui peut être intégré dans d'autres applications Java. |
| Source : [[http://jmol.sourceforge.net/|Site officiel]] | Source : [[http://jmol.sourceforge.net/|Site officiel]] | ||
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| - | <note>Pour l'instant seule la partie "application indépendante" est présentée.</note> | ||
| ===== Pré-requis ===== | ===== Pré-requis ===== | ||
| + | * Disposer des [[:sudo|droits d'administration]]. | ||
| * Disposer d'une connexion à Internet configurée et activée. | * Disposer d'une connexion à Internet configurée et activée. | ||
| - | * Avoir [[:tutoriel:comment_installer_un_paquet|installé]] [[:java|Java]]. | + | * Avoir [[:tutoriel:comment_installer_un_paquet|installé]] [[:Java]]. |
| ===== Installation ===== | ===== Installation ===== | ||
| - | + | Pour installer ce logiciel, il suffit d'[[:tutoriel:comment_installer_un_paquet|installer les paquets]] **[[apt>jmol]]** et **[[apt>jmol-applet]]** si vous souhaitez l'applet pour navigateur web. | |
| - | <note important>Sans les droits d'administration, l'installation présentée ci-dessous se fait en local, dans le dossier de l'utilisateur courant. Le logiciel ne sera donc pas disponible pour les autres utilisateurs.</note> | + | |
| - | * Télécharger l'archive du logiciel sur [[http://sourceforge.net/projects/jmol/|Sourceforge]]. | + | |
| - | * [[:archivage#graphiquement|Ouvrir l'archive]] et décompresser uniquement le fichier JMol.jar dans le dossier de votre choix. L'archive de départ peut maintenant être supprimée. | + | |
| - | * Un [[:raccourci-lanceur#creation_d_un_nouveau_lanceur|lanceur]] peut être crée avec la commande ''java -jar /chemin/vers/JMol.jar''. | + | |
| - | + | ||
| - | ===== Configuration ===== | + | |
| ===== Utilisation===== | ===== Utilisation===== | ||
| - | + | Lancez l'application via le [[:unity#tableau_de_bord_dash|tableau de bord]] (Unity) ou via le [[:terminal]] (toutes versions d'Ubuntu) avec la [[:commande_shell|commande]] suivante : <code>jmol</code> | |
| - | Lancez l'application depuis le menu //Applications -> Quelque chose -> JMol// si vous avez crée un lanceur avec ce nom dans le menu ou //via// la [[:commande_shell|commande]] suivante : | + | |
| - | + | ||
| - | java -jar /chemin/vers/JMol.jar | + | |
| ===== Désinstallation ===== | ===== Désinstallation ===== | ||
| - | Pour supprimer cette application, il suffit de supprimer le fichier JMol.jar. | + | Pour supprimer cette application, il suffit de [[:tutoriel:comment_supprimer_un_paquet|supprimer son paquet]]. Selon la méthode choisie, la configuration globale de l'application est conservée ou supprimée. Les journaux du système, et les fichiers de préférence des utilisateurs dans leurs dossiers personnels sont toujours conservés. |
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| ===== Voir aussi ===== | ===== Voir aussi ===== | ||
| - | * **(en)** [[http://wiki.jmol.org[Wiki officiel du logiciel]] | + | * **(en)** [[http://wiki.jmol.org|Wiki officiel du logiciel]] |
| * **(fr)** [[http://jmol.sourceforge.net/index.fr.html|Site officiel du logiciel]] | * **(fr)** [[http://jmol.sourceforge.net/index.fr.html|Site officiel du logiciel]] | ||
| - | * [[http://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?pid=3951562|Discussion « Installation de JMol »]] sur le forum Ubuntu-fr | + | * [[https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?pid=3951562|Discussion « Installation de Jmol »]] sur le forum Ubuntu-fr |
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| //Contributeurs principaux : [[:utilisateurs:kamui57]].// | //Contributeurs principaux : [[:utilisateurs:kamui57]].// | ||
| - | //Basé sur [[http://wiki.jmol.org/index.php/Jmol_Application#Installing_Jmol_Application|« JMol Wiki - JMol Application »]] par JeNeSaisPasQui.// | + | //Basé sur [[http://wiki.jmol.org/index.php/Jmol_Application#Installing_Jmol_Application|« Jmol Wiki - Jmol Application »]] par JeNeSaisPasQui.// |